初音未來：解謎音樂彗星目標是要在以樂曲為主題的關卡中進行冒險，玩家要一邊聽著樂曲一邊在關卡中收集所有「音符」來讓樂曲完成。每次獲得音符都會增加樂曲的章節(jié)使樂曲慢慢完成。游戲操作方式簡單，玩家只需將角色往上或往下移動即可，關卡中有觸碰到會受傷的地板、可彈跳的地板等各種障礙，必須一一克服。在前進的過程中，玩家可以看到初音超萌的表現(xiàn)，如果你是初音飯一定不要錯過。而在其它初音類游戲中必不可少的換裝元素，本作中依舊存在哦。玩家在游戲中可以更換初音未來等登場角色的「發(fā)型」、「衣裝」、「右手」、「左手」等部件，打造出屬于自己的虛擬人偶。在游玩過程中獲取更多道具的話，可搭配的組合也會更多樣化。